Per software di affiliazione si intende abitualmente uno script web, per lo più in PHP ma anche in ASP o JSP e Perl che consente di gestire il programma di affiliazione, dalla visualizzazione dei banner al tracking di utenti e vendite.
I software di affiliazione dispongono abitualmente di un'area riservata per gli affiliati dalla quale è possibile visuaizzare le statistiche sull'andamento dei guadagni, prelevare i codici html per visualizzare i banner sul proprio sito e diverse altre funzionalità a seconda della complessità del software.